257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4966 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  100 
 
 		 415 aa  788    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 		 414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 433 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 415 aa  229  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 410 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 416 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  34.62 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  29.75 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 416 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  33.79 
 
 		 416 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  28.42 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  31.49 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  27.2 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  38.86 
 
 		 216 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  28.61 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 369 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 426 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 402 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 400 aa  88.2  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  32.2 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  24.35 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.93 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  24.58 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.52 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  22.18 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  26.56 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  30 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  23.91 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  23.66 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.07 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>