195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0217 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  762    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  53.28 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  46.13 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  44.59 
 
 		 395 aa  236  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  33.78 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 433 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  30.15 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  28.01 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  40.36 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  27.23 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  33.76 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  28.79 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.27 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  26.61 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.14 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.01 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  24.41 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  23.18 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>