More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2451 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  817    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  80.54 
 
 		 405 aa  627  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  85.01 
 
 		 408 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  75.63 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  30.55 
 
 		 434 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.62 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 406 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 410 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 422 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.87 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 427 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.82 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  27.72 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.19 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 414 aa  100  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 431 aa  99.8  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 422 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 420 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  29.21 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  29.67 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 436 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 413 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 402 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.57 
 
 		 430 aa  96.3  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.65 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 428 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 432 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 424 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 433 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  26.03 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 452 aa  89.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.91 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 429 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  24.81 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.33 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  26.03 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.06 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  27.81 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>