180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0211 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 415 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 403 aa  205  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  36.32 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 442 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 416 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  34.07 
 
 		 416 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  33.15 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  29.21 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  28.87 
 
 		 402 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 402 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  31.93 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 399 aa  136  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  28.21 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 426 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 416 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  29.89 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 408 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  24.51 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  30.84 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  34.43 
 
 		 216 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  20.66 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.59 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  26.81 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  20.86 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.93 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  24.9 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>