62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1547 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  758    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  35.29 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 402 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 397 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  30.05 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 387 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 426 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  22.29 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  25.34 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  32.37 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  24.11 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  28.45 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  23.6 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  32.12 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  26.72 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  24.75 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>