103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1517 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  754    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  49.34 
 
 		 391 aa  279  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  47.54 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 387 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  41.74 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  42.49 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 390 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  33.25 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 408 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  31.32 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  35 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  32.2 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 408 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  32.78 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 408 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  32.89 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  28.3 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 433 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 422 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  31.07 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  30.89 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 405 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.87 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  26.29 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  26.79 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.51 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>