154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0467 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  772    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 410 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  37.81 
 
 		 414 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  32.87 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  31.3 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  33.23 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  33.71 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.66 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  31.14 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  31.82 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  33.71 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  34.89 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 387 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 399 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  27.25 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 408 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 405 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 400 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  38.07 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.29 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  28.52 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  24.4 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  29.24 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 459 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1997  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>