77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2181 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  100 
 
 		 369 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  66.38 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  54.03 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 391 aa  256  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 408 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 386 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  37.93 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 397 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 402 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  35 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 399 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 400 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  32.86 
 
 		 397 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  28.12 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 408 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  27.25 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  27.51 
 
 		 402 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  27.09 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  26.59 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  28.73 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  28.74 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 401 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  27.63 
 
 		 395 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  31.61 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  25 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  22.07 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.36 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>