109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3121 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 399 aa  766    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 400 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  33.17 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  30.3 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 426 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  31.61 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 387 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 394 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  32.68 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  25.85 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 416 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  29.44 
 
 		 416 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  30.14 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  45.61 
 
 		 151 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  25.59 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 408 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  27.99 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  24.71 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  30.86 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.4 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.96 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  26.61 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1791  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0460445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.32 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.42 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8475  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746267  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 410 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  30.57 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>