36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8475 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8475  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 446 aa  845    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 405 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  31.87 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  25.23 
 
 		 500 aa  51.2  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  21.84 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 405 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 399 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  26.45 
 
 		 606 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>