241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3796 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  789    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 		 415 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 408 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  42.96 
 
 		 415 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 405 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.07 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 430 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  29.59 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 403 aa  117  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  34.01 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  35.29 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  32.97 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  42.68 
 
 		 216 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.9 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  29.75 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 424 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 402 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 426 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  32.13 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 408 aa  90.1  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  30.62 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  26.65 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  26.24 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.17 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  26.72 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  31.9 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  20.86 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.11 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>