157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4143 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 402 aa  778    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  95.51 
 
 		 402 aa  720    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 410 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 410 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  28.65 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 442 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  28.25 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 411 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  29.3 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  29.83 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  30.77 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  29.57 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 416 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  25.66 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  26.77 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.62 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  29.75 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.98 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.16 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  23.4 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  23.4 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  22.75 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  22.59 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  25.23 
 
 		 480 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>