108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3887 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  731    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  50.14 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  48.67 
 
 		 426 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  48.26 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  49.56 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 408 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  47.89 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  47.43 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 411 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 410 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 393 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 410 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  39.33 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 402 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  36.03 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  34.25 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 411 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  36.74 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 369 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 417 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  33.61 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  33.52 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  31.09 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.79 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 405 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 416 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  29.26 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  36.05 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  30.95 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  27.46 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  29.52 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  30.97 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  30.27 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  38.61 
 
 		 151 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  28.64 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  30.12 
 
 		 480 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3053  sugar phosphate permease-like  24.44 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  26.63 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.46 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>