159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8610 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  792    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  76.54 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 442 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  50.14 
 
 		 415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 408 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 410 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  33.53 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  31.55 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 419 aa  126  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.48 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  29.91 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  31.55 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 432 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  31.59 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  27.9 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  38.18 
 
 		 216 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  25.57 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  30.64 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  28 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.05 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  24.21 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  20.98 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25.25 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  27.8 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  24 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  26.2 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>