More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1540 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  804    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 409 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.9 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  27.4 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0990  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.72949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  25.42 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  21.56 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25.59 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  24.87 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25.07 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  24.94 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  23.94 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.92 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.48 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.47 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.27 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  25.07 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  25.07 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  23.69 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  23.69 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  23.87 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  23.69 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  26.69 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  24.79 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  24.79 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  24.79 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  26 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  26 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  26 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  26 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>