More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3096 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
431 aa  851    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
441 aa  156  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
421 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
424 aa  147  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  28.85 
 
 
421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
421 aa  132  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  28.67 
 
 
500 aa  124  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  26.45 
 
 
415 aa  123  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  24.17 
 
 
439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.69 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
429 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
405 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  28.61 
 
 
414 aa  104  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
420 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.8 
 
 
434 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0055  conjugated bile Salt transporter  24.5 
 
 
451 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  22.84 
 
 
414 aa  89.7  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  26.03 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.17 
 
 
486 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  34.19 
 
 
184 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  25.07 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.33 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  26.33 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  25.06 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  24.67 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  25.38 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  23.41 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  24.07 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  23.42 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.26 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.25 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25.07 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  24.93 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  27.9 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  25.18 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  27.66 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  24.04 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  22.43 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  22.2 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  27.25 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  23.32 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  27.25 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.23 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  27.02 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  27.02 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  27.02 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
424 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  23.54 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  26.14 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.59 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  26.65 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  25.18 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.29 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  25.77 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.68 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.68 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  21.53 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  24.87 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  22.59 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  25.41 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  25.07 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  23.56 
 
 
432 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  23.35 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  25.31 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
432 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  23.35 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  25.59 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  25.24 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.69 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  24.26 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  24.22 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
431 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  23.73 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  24.22 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  21.93 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  24.51 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  24.82 
 
 
443 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
433 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  24.06 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  24.51 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>