153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0509 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  833    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 426 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  27.99 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  28.8 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  25.6 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  33.1 
 
 		 184 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  25.12 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.75 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  24.47 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  28.11 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.94 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.6 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  24.35 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  23.11 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0055  conjugated bile Salt transporter  21.96 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.84 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  20.17 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  27.45 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  26.47 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  30.49 
 
 		 506 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 407 aa  53.9  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 437 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 436 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 436 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3891  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 404 aa  53.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  20.3 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  24.27 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  29.58 
 
 		 606 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  25 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 439 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  25.98 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  25.98 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.83 
 
 		 452 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>