More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3959 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  817    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  73.32 
 
 		 405 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  73.01 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  74.81 
 
 		 408 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  30.5 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.92 
 
 		 404 aa  96.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.94 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  26.54 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  27.55 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.82 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  27.86 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.72 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  25.73 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  27.22 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  25.99 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  29.73 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  27.62 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  26.75 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3053  sugar phosphate permease-like  24.37 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  28.46 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  26.67 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  29.41 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>