247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1793 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  35.37 
 
 		 415 aa  96.3  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 420 aa  89  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  33.94 
 
 		 500 aa  87.8  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 431 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 441 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  33.58 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 426 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 486 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 412 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  32 
 
 		 439 aa  74.7  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 421 aa  72  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 432 aa  72.4  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 421 aa  71.2  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.63 
 
 		 434 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  30 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 417 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 442 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 427 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 413 aa  58.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 428 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 422 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  32.97 
 
 		 432 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0055  conjugated bile Salt transporter  30.06 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 433 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.61 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.86 
 
 		 423 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 423 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 427 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  35.53 
 
 		 410 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 408 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 441 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 431 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 414 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 439 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 427 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 401 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 405 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.74 
 
 		 430 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 428 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 404 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 424 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 442 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  31.58 
 
 		 430 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 418 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  31.58 
 
 		 429 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 429 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 427 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 417 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 436 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 427 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 421 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 424 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 437 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 402 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 427 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 442 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 441 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 422 aa  50.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 420 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 408 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  33 
 
 		 427 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 416 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 424 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 409 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  33 
 
 		 427 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 428 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 410 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 411 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  33 
 
 		 427 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  33 
 
 		 427 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1376  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 439 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.757312  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.59 
 
 		 435 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 427 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 411 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 427 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 427 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 411 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 411 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  33 
 
 		 427 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  33 
 
 		 427 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  33 
 
 		 427 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  33 
 
 		 427 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 443 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 427 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>