227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0305 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  832    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 421 aa  162  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 424 aa  156  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  28.64 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  28.23 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  27.27 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  25 
 
 		 500 aa  97.1  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 486 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  24.76 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  28.23 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.68 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.62 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  29.3 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  27.15 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25.67 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  26.82 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  24.92 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  26.49 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.22 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  23.46 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  21.77 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  25.07 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  20.72 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>