More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1022 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
412 aa  816    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
421 aa  223  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
424 aa  212  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
441 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 
426 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
421 aa  156  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  26.85 
 
 
415 aa  139  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
431 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
420 aa  138  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  27.6 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  27.62 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0414  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
432 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  hitchhiker  0.0000294242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
405 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
433 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
433 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.1 
 
 
442 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.65 
 
 
414 aa  92.8  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
442 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  25.52 
 
 
425 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  23.31 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.88 
 
 
436 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.54 
 
 
435 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.9 
 
 
400 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.13 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.63 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25.26 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  23.18 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  22.67 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  23.84 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  24.63 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  23.53 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  25.94 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  25.74 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  24.22 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  24.91 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  24.34 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  30.46 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  27.61 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  23.53 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.4 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  23.88 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  23.88 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  23.88 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  23.88 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  24.74 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  23.53 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  29.67 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  24.13 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.82 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  24.4 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  24.4 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  24.4 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  24.4 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  24.4 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  24.4 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  23.7 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  23.08 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  23.76 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  22.84 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  24.34 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  22.67 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  23.59 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  22.56 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  23.79 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  25.84 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  26.52 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  25.45 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  23.46 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  24.67 
 
 
433 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  25.84 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.93 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  21.72 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  23.8 
 
 
459 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  25.32 
 
 
486 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  26.52 
 
 
410 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  26.63 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 
409 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  25.45 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  25.94 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  30.77 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  30.77 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  30.77 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  22.42 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>