114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0055 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0055  conjugated bile Salt transporter  100 
 
 		 451 aa  902    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  22.68 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  26.34 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.79 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  21.87 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  23.49 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  30.06 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 452 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.92 
 
 		 412 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  25.07 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  23.53 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  20.27 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  23.97 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  22.32 
 
 		 438 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  21.86 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  22.59 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  20.8 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.55 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  23.78 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.79 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  22.93 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  21.24 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  24.02 
 
 		 528 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  23.32 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  20.57 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 411 aa  50.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  22.78 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  23.68 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  25.47 
 
 		 893 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  22.94 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  20.77 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  25.31 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  23.38 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  20.98 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  20.67 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  21.33 
 
 		 454 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  27.83 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  24.1 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  22.98 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  19.38 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  20.36 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  20.36 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  23.86 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  23.86 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  23.86 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  20.48 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  22.14 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  22.14 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  21.26 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  18.78 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  21.51 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  20.36 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  20.69 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  23.61 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>