81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6069 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  812    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  63.3 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  37.47 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 		 426 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  37.88 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  33.79 
 
 		 395 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  33.42 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 391 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  30 
 
 		 369 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  27.81 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 394 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  29.97 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  35.91 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 433 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  27.46 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  26.13 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  32.53 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  25.64 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  21.02 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  27.1 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  26.17 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  23.82 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 487 aa  43.1  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>