101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5581 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 395 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  73.28 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  52.17 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  49.33 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  40.06 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  43.35 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 386 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  34.25 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  31.35 
 
 		 414 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 399 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  31.82 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  28.96 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  31.27 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  34.6 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  32 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  30.34 
 
 		 415 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  29.57 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.52 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  28.22 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.61 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  24.87 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  23.81 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.5 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  30.19 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  30.19 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  23.72 
 
 		 510 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  23.72 
 
 		 510 aa  43.9  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  23.72 
 
 		 510 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 457 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>