124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1050 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 391 aa  723    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  82.86 
 
 		 426 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  85.45 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  77.75 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  62.4 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  60.99 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  60.43 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  60.96 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  69.89 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  48 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 369 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  45.66 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 402 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  44.26 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  35.19 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  31.61 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 408 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 408 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  34.29 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  34.1 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  32.33 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 403 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  32.25 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  31.83 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  30.66 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.78 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  30.18 
 
 		 216 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.57 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  41.58 
 
 		 151 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.67 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  29.31 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.81 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  26.06 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 436 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  29.66 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>