242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5529 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  61.34 
 
 		 440 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  29.93 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  26 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1791  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0460445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0990  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.72949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.99 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 427 aa  90.5  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 417 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 427 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 427 aa  86.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  25.43 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.69 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.06 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  25.18 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  24.82 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  25.58 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  23.64 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 486 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  26.19 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  24.59 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.08 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  24.26 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25.58 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  23.6 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  22.15 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  22.97 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  24.1 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>