190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1341 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  815    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  61.96 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  62.09 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  57.66 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  56.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  58.64 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  58.02 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  53.71 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  50 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  51.21 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  50.48 
 
 		 434 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  50.84 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  48.54 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  48.65 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  48.88 
 
 		 409 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  52.81 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 404 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 404 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 409 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  46.53 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  51.83 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 459 aa  240  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 		 397 aa  229  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  43.38 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  41.88 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  40.36 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  40.36 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  40.36 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  40.36 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  40.78 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  40.58 
 
 		 394 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  37.89 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  37.89 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  37.89 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  37.89 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  37.89 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  37.89 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  37.89 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  39.41 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  37.4 
 
 		 398 aa  203  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 397 aa  203  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  37.89 
 
 		 393 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  32.58 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 403 aa  199  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  34.64 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 434 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 398 aa  190  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  36.78 
 
 		 406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  36.27 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 445 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  38.32 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  41.26 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 399 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 403 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 403 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 496 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 408 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  34.19 
 
 		 419 aa  156  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 409 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 439 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2000  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  34 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  28.39 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>