186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1910 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  855    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  54.74 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  54.35 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  49.14 
 
 		 403 aa  342  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  45.01 
 
 		 395 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  44.17 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  44.17 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  44.17 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 411 aa  297  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  44.17 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  44.17 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  44.17 
 
 		 398 aa  295  9e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  43.93 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  43.69 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  43.93 
 
 		 393 aa  292  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  45.23 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  44.99 
 
 		 394 aa  282  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  45.23 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  45.23 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  44.99 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  34.09 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 426 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  34.93 
 
 		 426 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  34.99 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  33.75 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  30.38 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  30.89 
 
 		 414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 397 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  33.08 
 
 		 434 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  33.33 
 
 		 426 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  34.16 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  33.33 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  32.51 
 
 		 382 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 423 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  32.2 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  30.77 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  34.41 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  34.74 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  31.73 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  32.05 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  32.32 
 
 		 397 aa  156  7e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 401 aa  156  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 421 aa  153  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  27.37 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  30.83 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 428 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 459 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 466 aa  143  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  29.68 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  30.79 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 436 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  28.09 
 
 		 388 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  30.98 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 410 aa  130  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  26.87 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03160  cyanate permease  30.34 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>