187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7247 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
409 aa  780    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  56.27 
 
 
428 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  53.27 
 
 
411 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  51.17 
 
 
404 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  44.8 
 
 
436 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  43.81 
 
 
466 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  44.33 
 
 
414 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 
413 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 
401 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 
417 aa  252  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  41.84 
 
 
403 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  41.84 
 
 
403 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  41.84 
 
 
403 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  42.26 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  41.35 
 
 
434 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  39.89 
 
 
434 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  39.52 
 
 
414 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  40.81 
 
 
426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  38.5 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  40.54 
 
 
426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3455  major facilitator transporter  41.8 
 
 
369 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  40.53 
 
 
426 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 
403 aa  226  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 
496 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  40.21 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  39.05 
 
 
403 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  36.6 
 
 
421 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  43.01 
 
 
406 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 
424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  44.62 
 
 
387 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 
397 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  39.26 
 
 
404 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  35.05 
 
 
403 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  37.75 
 
 
426 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  39.95 
 
 
403 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  36.98 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 
439 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
404 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
404 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  37.02 
 
 
402 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  39.79 
 
 
459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  39.4 
 
 
424 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 
410 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 
430 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
430 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 
445 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  39.58 
 
 
388 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  41.18 
 
 
404 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  33.69 
 
 
416 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  32.45 
 
 
411 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
426 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  37.37 
 
 
451 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  38.59 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  39.9 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  36.46 
 
 
426 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  32.99 
 
 
398 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  35.75 
 
 
391 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  35.01 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  35.01 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  35.01 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  35.01 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 
396 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  34.76 
 
 
394 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  34.46 
 
 
395 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  29.28 
 
 
394 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  28.79 
 
 
396 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  35.06 
 
 
393 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  35.06 
 
 
393 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  34.72 
 
 
398 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  30.77 
 
 
434 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  35.06 
 
 
393 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  35.06 
 
 
393 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  35.06 
 
 
393 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  35.06 
 
 
393 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  35.06 
 
 
393 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  35.14 
 
 
406 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  33.33 
 
 
402 aa  169  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  37.34 
 
 
405 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  35.17 
 
 
382 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
423 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  37.22 
 
 
432 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  37.33 
 
 
401 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  34.72 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03160  cyanate permease  33.51 
 
 
405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  35.05 
 
 
409 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14270  cyanate permease  34.68 
 
 
423 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000572632  normal  0.0539655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  30.45 
 
 
404 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  33.52 
 
 
394 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  34.33 
 
 
398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
398 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
361 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  35.44 
 
 
444 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  29.1 
 
 
368 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 
399 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 
421 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>