197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5426 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
396 aa  751    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  50.52 
 
 
403 aa  339  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  48.72 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  48.72 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  48.72 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  48.72 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  48.72 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  48.47 
 
 
393 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  48.47 
 
 
393 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  48.47 
 
 
398 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  44.17 
 
 
411 aa  315  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  49.47 
 
 
395 aa  315  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  48.21 
 
 
393 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  51.15 
 
 
394 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  51.15 
 
 
394 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  50.89 
 
 
394 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  51.15 
 
 
394 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  50.89 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  43.9 
 
 
434 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  43.42 
 
 
416 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 
398 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  43.18 
 
 
398 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  45.66 
 
 
402 aa  289  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  38.86 
 
 
404 aa  263  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 
439 aa  245  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
413 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 
424 aa  235  9e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  45.17 
 
 
403 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  42.08 
 
 
406 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 
397 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  38.93 
 
 
426 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  38.4 
 
 
434 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  38.67 
 
 
426 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  37.17 
 
 
414 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  38.4 
 
 
426 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 
426 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  36.31 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  37.97 
 
 
434 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 
423 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  38.42 
 
 
407 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  37.24 
 
 
404 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 
404 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 
404 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
435 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 
399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  36.2 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  29.22 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  36.39 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 
430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  35.79 
 
 
426 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 
361 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  35.89 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  39.94 
 
 
401 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  34.88 
 
 
409 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  36.08 
 
 
391 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 
430 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  36.93 
 
 
432 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
496 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  34.68 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  36.75 
 
 
405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  35.16 
 
 
406 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  34.43 
 
 
403 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  34.43 
 
 
403 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  35.62 
 
 
424 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  36.87 
 
 
405 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  33.06 
 
 
429 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  32.13 
 
 
390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  37.01 
 
 
388 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  37.14 
 
 
404 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  33.96 
 
 
409 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  32.87 
 
 
402 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
428 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  30.85 
 
 
436 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  33.51 
 
 
451 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  32.14 
 
 
439 aa  159  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  35.36 
 
 
424 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
410 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  35.87 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  30.35 
 
 
397 aa  152  8e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 
411 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
413 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  35.32 
 
 
404 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 
403 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 
397 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  36.75 
 
 
366 aa  143  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
445 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  28.11 
 
 
387 aa  142  9e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  34.14 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  35.29 
 
 
466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
437 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  34.58 
 
 
421 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  35.55 
 
 
409 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  35.38 
 
 
414 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  35.69 
 
 
415 aa  136  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  32.71 
 
 
387 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  34.29 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  31.87 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  30.18 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
401 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>