184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1932 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  759    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  53.71 
 
 
426 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  52.06 
 
 
430 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  51.91 
 
 
430 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  49.05 
 
 
434 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  49.2 
 
 
426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  50.42 
 
 
432 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  50.14 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  49.72 
 
 
426 aa  302  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  50 
 
 
426 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  49.45 
 
 
434 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  48.68 
 
 
391 aa  295  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  49.32 
 
 
382 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  48.84 
 
 
403 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  45.72 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  45.6 
 
 
414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  48.65 
 
 
424 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  42.05 
 
 
409 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  47.84 
 
 
424 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  43.19 
 
 
426 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  46.22 
 
 
407 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 
404 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 
404 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 
437 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  44.27 
 
 
444 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  44.7 
 
 
401 aa  219  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  38.44 
 
 
402 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 
435 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  44.26 
 
 
459 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
397 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
413 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  40.87 
 
 
404 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 
397 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 
410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  39.78 
 
 
404 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  39.74 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  35.49 
 
 
403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  35.37 
 
 
398 aa  183  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  37.5 
 
 
393 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  37.24 
 
 
393 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  37.24 
 
 
393 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  35.2 
 
 
403 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  35.2 
 
 
403 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  37.24 
 
 
393 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  37.24 
 
 
393 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  37.24 
 
 
393 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  37.24 
 
 
393 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  37.24 
 
 
398 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  34.53 
 
 
403 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  41.44 
 
 
403 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  37.66 
 
 
393 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
424 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  35 
 
 
406 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  37.4 
 
 
406 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  37.23 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  38.62 
 
 
394 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  38.86 
 
 
404 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  38.36 
 
 
394 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 
445 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  38.36 
 
 
394 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  38.36 
 
 
394 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  38.93 
 
 
387 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  35.93 
 
 
402 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  38.1 
 
 
394 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
361 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  37.73 
 
 
395 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
415 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  38.6 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 
413 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  37.07 
 
 
436 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  31.73 
 
 
434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 
411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  28.15 
 
 
396 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  38.99 
 
 
405 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 
496 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 
396 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  28.88 
 
 
394 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
439 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 
400 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
398 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  36.22 
 
 
406 aa  156  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  31.46 
 
 
411 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  32.25 
 
 
416 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  35.36 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 
421 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  36.31 
 
 
408 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  35.26 
 
 
409 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  32.73 
 
 
404 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  32.35 
 
 
398 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  36.41 
 
 
466 aa  143  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  40.15 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  31.38 
 
 
436 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  33.71 
 
 
394 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  34.22 
 
 
419 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  34.04 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  30.79 
 
 
439 aa  137  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>