223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0280 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  741    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  40 
 
 
414 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  39.3 
 
 
402 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  38.26 
 
 
409 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  29.19 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  37.97 
 
 
426 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  37.97 
 
 
434 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  39.73 
 
 
407 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 
430 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  37.68 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  29.36 
 
 
394 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  37.75 
 
 
434 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  35.9 
 
 
394 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  40 
 
 
424 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 
430 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 
404 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 
404 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  37.68 
 
 
426 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  37.5 
 
 
408 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  37.64 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  37.46 
 
 
403 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  38.93 
 
 
426 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  31.94 
 
 
398 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  34.83 
 
 
426 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  35.6 
 
 
409 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  34.17 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  39.17 
 
 
404 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
396 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  37.33 
 
 
405 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  36.54 
 
 
432 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
397 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
413 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  34.2 
 
 
401 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  34.46 
 
 
401 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
410 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 
424 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  34.2 
 
 
401 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  38.9 
 
 
424 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  35.05 
 
 
409 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 
401 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  36.39 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  36.34 
 
 
382 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  34.51 
 
 
409 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  32.45 
 
 
416 aa  153  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  37.01 
 
 
387 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 
428 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 
411 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  35.97 
 
 
404 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  33.51 
 
 
401 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  34.66 
 
 
409 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  32.33 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  34.29 
 
 
403 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  32.01 
 
 
408 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  34.99 
 
 
391 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  30.63 
 
 
411 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  32.11 
 
 
404 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  34.52 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  35.79 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  32.96 
 
 
409 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  32.19 
 
 
408 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  30.99 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  30.03 
 
 
434 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  32.79 
 
 
398 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  32.4 
 
 
395 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  37.71 
 
 
459 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  34.06 
 
 
419 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  34.88 
 
 
390 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
496 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1245  major facilitator transporter  31.92 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.356347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  32.79 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  32.7 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  34.25 
 
 
403 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  32.81 
 
 
397 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  32.7 
 
 
393 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  34.25 
 
 
403 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
445 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  32.43 
 
 
398 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  33.06 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  32.52 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 
437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  34.25 
 
 
403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  32.43 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  32.43 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  32.43 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  32.43 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  32.43 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  32.85 
 
 
451 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  35.62 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  32.78 
 
 
394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  32.78 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  37.23 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  36.89 
 
 
388 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>