195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0970 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  100 
 
 
434 aa  841    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  88.73 
 
 
426 aa  715    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  79.03 
 
 
434 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  93.43 
 
 
426 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  97.65 
 
 
426 aa  780    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  78.72 
 
 
409 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  74.64 
 
 
414 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  69.51 
 
 
424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  69.51 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  57.71 
 
 
404 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  57.71 
 
 
404 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  58.93 
 
 
426 aa  395  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  55.1 
 
 
403 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  55.32 
 
 
407 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 
426 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  49.14 
 
 
432 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
430 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  50.27 
 
 
402 aa  323  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 
430 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  49.64 
 
 
426 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  55.24 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  49.6 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  49.74 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  49.2 
 
 
405 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  50.14 
 
 
459 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  44.02 
 
 
409 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 
410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 
437 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  43.62 
 
 
444 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  42.45 
 
 
409 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  48.95 
 
 
405 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 
397 aa  253  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  40.82 
 
 
403 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 
424 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 
435 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  37.04 
 
 
411 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  39.58 
 
 
451 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 
439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 
428 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  42.21 
 
 
404 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  40.84 
 
 
404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  41.29 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  41.02 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  41.02 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  40.96 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  39.79 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  41.05 
 
 
394 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 
445 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  41.42 
 
 
403 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  39.28 
 
 
393 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  39.28 
 
 
393 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  39.28 
 
 
393 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  39.28 
 
 
393 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  41.05 
 
 
394 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  39.28 
 
 
393 aa  209  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  39.28 
 
 
393 aa  209  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  41.05 
 
 
394 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  39.28 
 
 
393 aa  209  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  40.79 
 
 
394 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  37.98 
 
 
416 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  40 
 
 
406 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  39.02 
 
 
398 aa  207  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  40.79 
 
 
394 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  41.34 
 
 
404 aa  206  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  39.01 
 
 
406 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  40.27 
 
 
395 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  41.4 
 
 
387 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
397 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
396 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  37.71 
 
 
436 aa  199  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  34.65 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  42.02 
 
 
366 aa  192  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  34.9 
 
 
404 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  35.11 
 
 
402 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  33.73 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 
398 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 
399 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30.96 
 
 
394 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  30.43 
 
 
396 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  39.89 
 
 
406 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2000  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
394 aa  179  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  37.46 
 
 
400 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  30.27 
 
 
439 aa  177  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  36.81 
 
 
466 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 
401 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  29.46 
 
 
387 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
423 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  29.55 
 
 
436 aa  170  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  37.9 
 
 
419 aa  169  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  30.36 
 
 
429 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  29.87 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  35 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  30.71 
 
 
390 aa  163  7e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>