216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32330 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  92.16 
 
 
408 aa  681    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  100 
 
 
408 aa  783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  66.03 
 
 
398 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  66.21 
 
 
398 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  65.66 
 
 
398 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  50.5 
 
 
419 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  46.37 
 
 
409 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  47.12 
 
 
409 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  45.86 
 
 
409 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  46.81 
 
 
399 aa  273  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  45.65 
 
 
384 aa  272  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  44.68 
 
 
393 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  44.68 
 
 
393 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  45.38 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  45.12 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  45.38 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  45.91 
 
 
384 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  45.12 
 
 
384 aa  269  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  45.14 
 
 
394 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  42.6 
 
 
408 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  43.15 
 
 
409 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 
414 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  45.04 
 
 
391 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  43.33 
 
 
408 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  41.94 
 
 
398 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 
389 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 
389 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  43.16 
 
 
405 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  44.5 
 
 
420 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  41.85 
 
 
390 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  40.37 
 
 
401 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  40.87 
 
 
420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  39.84 
 
 
401 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  39.84 
 
 
401 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  39.58 
 
 
401 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 
401 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  40.78 
 
 
398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
393 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  40.86 
 
 
390 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 
384 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  39.68 
 
 
392 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  39.68 
 
 
392 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  42.4 
 
 
404 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  39.28 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  39.47 
 
 
394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  39.54 
 
 
427 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  40.1 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  42.21 
 
 
394 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  42.21 
 
 
394 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  41.93 
 
 
401 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  42.21 
 
 
394 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  34.83 
 
 
409 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 
426 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  34.5 
 
 
414 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  29.69 
 
 
396 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  32.48 
 
 
434 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  33.24 
 
 
426 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  32.95 
 
 
434 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  33.52 
 
 
426 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
396 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  32.95 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  43.21 
 
 
332 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  34.07 
 
 
426 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
404 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
404 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  31.28 
 
 
403 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  31.28 
 
 
403 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  31.81 
 
 
409 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  31.56 
 
 
403 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  28.73 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
428 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 
400 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  31.35 
 
 
407 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  29.89 
 
 
424 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 
411 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  32.98 
 
 
404 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  34.16 
 
 
401 aa  136  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  32.95 
 
 
403 aa  135  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  32.94 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  31.15 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  32.5 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  34.27 
 
 
466 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  28.43 
 
 
408 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  30.34 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  29.63 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  32.43 
 
 
451 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  33.15 
 
 
414 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2000  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
394 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
410 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  29.69 
 
 
406 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
430 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
397 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
445 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  32.09 
 
 
426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  33.42 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  30.97 
 
 
432 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  29.51 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>