195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4246 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  88.73 
 
 		 434 aa  715    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  100 
 
 		 426 aa  818    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  78.87 
 
 		 434 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  90.14 
 
 		 426 aa  725    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  88.97 
 
 		 426 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  75.12 
 
 		 409 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  73.67 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  70 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  69.76 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  57.55 
 
 		 404 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  57.55 
 
 		 404 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  59.42 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  56.35 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  54.96 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  51.21 
 
 		 426 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  50.47 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  51.46 
 
 		 426 aa  325  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  52.07 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  49.87 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  50 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  53.4 
 
 		 401 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 405 aa  302  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  44.89 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  51.78 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  48.27 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  48.31 
 
 		 405 aa  256  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  43.84 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  40.92 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  41.65 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  40.37 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 404 aa  222  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  42.27 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  40.26 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  41.67 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  40.94 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  41.67 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  39.74 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  39.74 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  39.74 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  39.74 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  39.74 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  39.74 
 
 		 393 aa  216  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  41.41 
 
 		 394 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  38.69 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  39.74 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 403 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  40.68 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  39.74 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  40.69 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  39.69 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  40.9 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  41.67 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 411 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 399 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 361 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 404 aa  189  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30.68 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2000  major facilitator superfamily MFS_1  36.28 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  40 
 
 		 406 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 368 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 400 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  30.05 
 
 		 436 aa  177  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 496 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  29.02 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  37.1 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 398 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 403 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>