255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4522 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  737    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  48.8 
 
 		 389 aa  322  8e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  51.89 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  48.03 
 
 		 392 aa  279  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  51.91 
 
 		 384 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  48.36 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 427 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 392 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 392 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  49.2 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  52.56 
 
 		 394 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  52.44 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  52.44 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  52.15 
 
 		 401 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  52.44 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 401 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  42.9 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  52.83 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  41.05 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  38.72 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  39.73 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  38.72 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  48.28 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  39.31 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  39.31 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  39.05 
 
 		 384 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  39.05 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  39.05 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  38.06 
 
 		 384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 396 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30.42 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 409 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  34.45 
 
 		 434 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  33.8 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  32.39 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  33.33 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  33.15 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  33.33 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  31.65 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 400 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  32.36 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  31.4 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  30.7 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  33.23 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  33.24 
 
 		 404 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  33.78 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  33.53 
 
 		 424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  32.29 
 
 		 426 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  31.32 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 496 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 410 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>