221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5382 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  100 
 
 
408 aa  770    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  52.3 
 
 
409 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  56.66 
 
 
420 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  57.18 
 
 
420 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  53.96 
 
 
405 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  47.8 
 
 
419 aa  278  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  47.04 
 
 
409 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  45.71 
 
 
399 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  43.85 
 
 
408 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  44.19 
 
 
408 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  45.79 
 
 
409 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  47.37 
 
 
409 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  44.47 
 
 
384 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  44.47 
 
 
384 aa  246  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  44.47 
 
 
384 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  44.47 
 
 
393 aa  246  8e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  44.47 
 
 
384 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  44.47 
 
 
393 aa  246  8e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  44.21 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  44.21 
 
 
384 aa  243  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  36.92 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 
414 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  36.18 
 
 
408 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  40.95 
 
 
391 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  41.67 
 
 
398 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  41.58 
 
 
398 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 
401 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  41.03 
 
 
398 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  37.73 
 
 
401 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  37.73 
 
 
401 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  37.47 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  37.04 
 
 
401 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  35.19 
 
 
398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  39.18 
 
 
404 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  37.47 
 
 
390 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  28.49 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  28.41 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
393 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  37.12 
 
 
398 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  35.9 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  35.57 
 
 
392 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  34.69 
 
 
392 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  34.69 
 
 
392 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
426 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  34.51 
 
 
394 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  34.6 
 
 
427 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
396 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  34.53 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  31.22 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  33.33 
 
 
403 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  33.33 
 
 
403 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  33.87 
 
 
432 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  31.95 
 
 
408 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  37.15 
 
 
394 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  33.07 
 
 
403 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
384 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  34.06 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
430 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  37.15 
 
 
394 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  37.15 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  36.9 
 
 
394 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  36.9 
 
 
394 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
437 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  31.11 
 
 
409 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  30.93 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  33.61 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  29.91 
 
 
426 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  30.94 
 
 
426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  29.95 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  30.48 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  30.14 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  33.06 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  31.4 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  29.91 
 
 
434 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
430 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  31.37 
 
 
401 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  30.17 
 
 
407 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
415 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  31.52 
 
 
387 aa  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  32.29 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  31.44 
 
 
406 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 
410 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  27.92 
 
 
404 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  30.77 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  29.61 
 
 
424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  30.75 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  30.41 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  36.02 
 
 
403 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  37.08 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  31.02 
 
 
393 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  30.75 
 
 
393 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>