248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5672 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
414 aa  791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  69.54 
 
 
419 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  49.34 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  47.39 
 
 
408 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  48.39 
 
 
408 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  47.78 
 
 
384 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  47.78 
 
 
384 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  47.78 
 
 
384 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  47.78 
 
 
393 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  47.78 
 
 
393 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  47.78 
 
 
384 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  47.52 
 
 
384 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  46.09 
 
 
409 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  47.78 
 
 
384 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  46.63 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  45.55 
 
 
409 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  45.95 
 
 
398 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  45.41 
 
 
398 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  45.41 
 
 
398 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  40.1 
 
 
394 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  38.36 
 
 
408 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  39.01 
 
 
409 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  46.19 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  38.02 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  41.03 
 
 
391 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  42.44 
 
 
420 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 
389 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 
389 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  37.8 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  37.53 
 
 
401 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  37.27 
 
 
401 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 
401 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  37.8 
 
 
401 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  41.13 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  40.67 
 
 
392 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  41.8 
 
 
390 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  38.34 
 
 
392 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  38.34 
 
 
392 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  39.69 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  40.46 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  39.74 
 
 
405 aa  200  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  43.24 
 
 
420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  38.29 
 
 
390 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  41.04 
 
 
404 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
393 aa  183  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  30.52 
 
 
396 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
404 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
404 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  35.63 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30 
 
 
394 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 
384 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  38.85 
 
 
394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  39.83 
 
 
401 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  39.83 
 
 
394 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
426 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  39.55 
 
 
394 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  39.55 
 
 
394 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 
430 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 
430 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 
400 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  33.7 
 
 
409 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  33.61 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  33.43 
 
 
414 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  32.47 
 
 
407 aa  143  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  32.87 
 
 
434 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  31.59 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  33.43 
 
 
401 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  33.06 
 
 
424 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  32.97 
 
 
426 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  31.53 
 
 
426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  30.88 
 
 
426 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  30.59 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  29.82 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  29.29 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  29.29 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  30.31 
 
 
434 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  31.87 
 
 
402 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  38.91 
 
 
332 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
445 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  30.13 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  30.13 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  31.28 
 
 
403 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  29.28 
 
 
391 aa  124  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  30.58 
 
 
405 aa  123  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  28.02 
 
 
404 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  31.22 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  31.96 
 
 
414 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  30.43 
 
 
432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  31.72 
 
 
436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  30.48 
 
 
406 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  31.3 
 
 
451 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  28.69 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  30.59 
 
 
387 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  28.28 
 
 
409 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  28.83 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  32 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>