189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1596 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  100 
 
 
394 aa  723    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  99.49 
 
 
401 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  100 
 
 
394 aa  723    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  99.75 
 
 
394 aa  721    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  99.24 
 
 
394 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  100 
 
 
332 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  85.9 
 
 
390 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  66.41 
 
 
398 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  66.58 
 
 
392 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  67.1 
 
 
427 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  66.16 
 
 
394 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  65.82 
 
 
392 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  65.82 
 
 
392 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  52.29 
 
 
391 aa  318  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  48.15 
 
 
389 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  48.55 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  52.71 
 
 
390 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 
384 aa  272  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  50.68 
 
 
393 aa  269  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  46.54 
 
 
394 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  46.03 
 
 
408 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  41.78 
 
 
398 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  42.71 
 
 
408 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  42.09 
 
 
399 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  41.67 
 
 
408 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  41.69 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  41.32 
 
 
401 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  45.74 
 
 
404 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  41.05 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  41.05 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  39.07 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  38.67 
 
 
384 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  38.67 
 
 
384 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  38.52 
 
 
398 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.579167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  38.67 
 
 
384 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  38.67 
 
 
393 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  38.4 
 
 
384 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  38.67 
 
 
393 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  38.67 
 
 
384 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  38.98 
 
 
409 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  38.13 
 
 
384 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  39.25 
 
 
409 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  40.59 
 
 
409 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  38.52 
 
 
398 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  42.41 
 
 
419 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  38.68 
 
 
420 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 
414 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  36.34 
 
 
408 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30.36 
 
 
394 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  29.81 
 
 
396 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  35.71 
 
 
405 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  35.81 
 
 
395 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  35.81 
 
 
395 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  35.23 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  34.69 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  34.69 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  36.74 
 
 
420 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  33.15 
 
 
414 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 
426 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  33.53 
 
 
408 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  35.34 
 
 
426 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  35.06 
 
 
426 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  37.33 
 
 
406 aa  146  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  35.06 
 
 
434 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  35.06 
 
 
426 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  32.39 
 
 
409 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  34.36 
 
 
409 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  32.85 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
404 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
404 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  32.74 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 
400 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  33.33 
 
 
406 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  31.56 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  35.71 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  34.44 
 
 
424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
413 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  35.36 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  34.83 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  36.15 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  33.15 
 
 
403 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  32.05 
 
 
409 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 
496 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  33.98 
 
 
426 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  32.29 
 
 
432 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
445 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  33.81 
 
 
401 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  31.4 
 
 
407 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  35.36 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  29.2 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
410 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  35.65 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  30.46 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
397 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  33.33 
 
 
466 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
430 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>