203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1589 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 389 aa  762    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  93.57 
 
 		 389 aa  698    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  65.45 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  63.45 
 
 		 384 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  50.93 
 
 		 391 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  48.94 
 
 		 390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  47.35 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  44.64 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 427 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  47.84 
 
 		 394 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  47.99 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  47.47 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  47.47 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  48.28 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  42.43 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  41.73 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 401 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  46.79 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  38.77 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  40.64 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  35.77 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  35.77 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  35.77 
 
 		 384 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  35.77 
 
 		 384 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  35.77 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  35.77 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  35.77 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  36.39 
 
 		 384 aa  192  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  36 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 414 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 398 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30.14 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 408 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  30.53 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  30.29 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  32.25 
 
 		 414 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  32.36 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  31.28 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  31.78 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  30.48 
 
 		 426 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  30.91 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  28.94 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 397 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 		 395 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 		 395 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  31.16 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 432 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  29.89 
 
 		 404 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  31.79 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  29.13 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  30.68 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  31.07 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  30.23 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  30.23 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  30.75 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  30.23 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  30.23 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  30.23 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  30.49 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>