199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1679 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  96.45 
 
 		 394 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  89.2 
 
 		 398 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  91.33 
 
 		 392 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  89.45 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  69.45 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  66.08 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  68.68 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  68.41 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  68.41 
 
 		 394 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  68.41 
 
 		 394 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  67.46 
 
 		 332 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  48.79 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  51.32 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  47.64 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  47.92 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  39.9 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 398 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  43.95 
 
 		 404 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  41.95 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  41.16 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  36.53 
 
 		 384 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  35.73 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  36 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  36.27 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  35.73 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  35.73 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  35.73 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 409 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  36 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  31.2 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 420 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  33.89 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  33.99 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  34.08 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  33.51 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  32.56 
 
 		 395 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  32.56 
 
 		 395 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  33.24 
 
 		 426 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  32.87 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  33.52 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  36.69 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 413 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  32.96 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  35.31 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  32.76 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  28.99 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  34.53 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  34.56 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  32.64 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  33.7 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 411 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>