181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3268 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  794    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  44.89 
 
 		 426 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  44.08 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  46.13 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  45.58 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  44.78 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  44.22 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  43.96 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  44.14 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  46.88 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  47.15 
 
 		 424 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 403 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  44.2 
 
 		 391 aa  262  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 405 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  41.56 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  44.17 
 
 		 382 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 407 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  41.74 
 
 		 401 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 		 397 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 413 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  39.34 
 
 		 451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  37.88 
 
 		 404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  35.36 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 397 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  34.56 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  34.65 
 
 		 394 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  33.24 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  34.38 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  34.38 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  34.12 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  34.12 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 361 aa  153  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  34.44 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 403 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 403 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  36.33 
 
 		 366 aa  147  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  27.4 
 
 		 394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  35.26 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  33.16 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  33.16 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  33.16 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  33.16 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  33.16 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  33.16 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  33.16 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  33.59 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  32.63 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  33.16 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 411 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  33.6 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 436 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 466 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  31.05 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  28.41 
 
 		 436 aa  123  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>