189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4528 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  100 
 
 
414 aa  769    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  87.34 
 
 
466 aa  611  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  45.78 
 
 
409 aa  303  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 
411 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  47.23 
 
 
436 aa  280  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 
428 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
397 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 
403 aa  252  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  43.6 
 
 
404 aa  250  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3455  major facilitator transporter  43.87 
 
 
369 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 
401 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 
417 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  39.79 
 
 
421 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  38.82 
 
 
403 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  38.82 
 
 
403 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
413 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  38.82 
 
 
403 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  38.76 
 
 
406 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  41.22 
 
 
406 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 
445 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  41.33 
 
 
387 aa  202  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
413 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
424 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  37.33 
 
 
409 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  34.1 
 
 
419 aa  183  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  36.97 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  36.27 
 
 
426 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  35.2 
 
 
434 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  35.04 
 
 
434 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  35.55 
 
 
426 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  38.21 
 
 
404 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  35.29 
 
 
426 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 
426 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  37.7 
 
 
451 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  36.18 
 
 
407 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3103  major facilitator transporter  36.2 
 
 
409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  36.73 
 
 
404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  39.89 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 
397 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  37.69 
 
 
388 aa  163  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 
430 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
430 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  34.99 
 
 
403 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  33.51 
 
 
402 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  31.65 
 
 
403 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  34.6 
 
 
406 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 
423 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  36.44 
 
 
424 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  31 
 
 
411 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  30.79 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  37.46 
 
 
405 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  28.19 
 
 
368 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  35.82 
 
 
426 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 
396 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  34.58 
 
 
394 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  35.71 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  34.58 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  35.88 
 
 
426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  35.71 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
410 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  34.13 
 
 
398 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  34.72 
 
 
432 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  34.33 
 
 
394 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  31.28 
 
 
416 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03160  cyanate permease  32.9 
 
 
405 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  35.11 
 
 
424 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  29.16 
 
 
436 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  32.54 
 
 
393 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  31.32 
 
 
409 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 
361 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  31.99 
 
 
394 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  33.33 
 
 
391 aa  143  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  32.72 
 
 
393 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  32.72 
 
 
393 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  32.72 
 
 
393 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  32.72 
 
 
393 aa  143  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  32.72 
 
 
393 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  32.28 
 
 
393 aa  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  32.01 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  31.66 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  32.72 
 
 
393 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  31.64 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  33.14 
 
 
382 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  35.15 
 
 
405 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  29.8 
 
 
439 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  34.49 
 
 
459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  31.93 
 
 
398 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
400 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  25.41 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
415 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  25.21 
 
 
394 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  31.66 
 
 
395 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  32.75 
 
 
444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  33.33 
 
 
408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>