201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00339 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  100 
 
 
421 aa  804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  58.52 
 
 
401 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  52.53 
 
 
413 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
403 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
411 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  37.02 
 
 
409 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  40.1 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  40.15 
 
 
404 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
428 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  36.39 
 
 
436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  39.7 
 
 
414 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 
496 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3455  major facilitator transporter  38.63 
 
 
369 aa  183  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  35.56 
 
 
403 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  35.31 
 
 
403 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  35.31 
 
 
403 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  34.45 
 
 
406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  32.49 
 
 
419 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  35.92 
 
 
387 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  37.96 
 
 
403 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  32.58 
 
 
414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  34.36 
 
 
404 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 
445 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03160  cyanate permease  32.56 
 
 
405 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  34.67 
 
 
406 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  32.29 
 
 
409 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
417 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  31.79 
 
 
388 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  28.5 
 
 
439 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  33.68 
 
 
451 aa  147  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  32.49 
 
 
426 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  25.38 
 
 
436 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  32.11 
 
 
434 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  31.37 
 
 
407 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  30.19 
 
 
403 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  33.6 
 
 
406 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  34.32 
 
 
394 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
424 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  32.2 
 
 
426 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  31.37 
 
 
434 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  33.33 
 
 
404 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  33.52 
 
 
424 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  26.8 
 
 
429 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  34.05 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  34.05 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  34.05 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  34.05 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  36.64 
 
 
459 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 
426 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
397 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  32.28 
 
 
426 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 
435 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
423 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
399 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
413 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  31.88 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  28.61 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  32.78 
 
 
424 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14270  cyanate permease  32.13 
 
 
423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000572632  normal  0.0539655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  27.34 
 
 
411 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  31.65 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  31.33 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  30.81 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  31.07 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  31.07 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  31.07 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  31.07 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  31.07 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  27.6 
 
 
390 aa  127  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  31.07 
 
 
393 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  27.05 
 
 
416 aa  127  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  28.46 
 
 
434 aa  126  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
415 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  25.53 
 
 
368 aa  126  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 
410 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  30.81 
 
 
398 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
437 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  31.3 
 
 
409 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3103  major facilitator transporter  30.47 
 
 
409 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  28.32 
 
 
402 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  31.99 
 
 
409 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  30.26 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  30.81 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  33.6 
 
 
405 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  24.48 
 
 
387 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  29.65 
 
 
384 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  29.11 
 
 
384 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  29.65 
 
 
384 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  26.48 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  29.11 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  29.11 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  29.11 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  29.11 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>