207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2757 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
388 aa  731    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  69.41 
 
 
404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  42.44 
 
 
434 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  42.98 
 
 
414 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  42.4 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  40.5 
 
 
426 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  40.77 
 
 
434 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 
413 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  41.06 
 
 
426 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  41.35 
 
 
426 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  43.42 
 
 
451 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  44.23 
 
 
459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  39.53 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  39.53 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  41.32 
 
 
407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  39.27 
 
 
403 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  37.98 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 
406 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  37.73 
 
 
393 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  37.73 
 
 
393 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  37.73 
 
 
393 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  37.73 
 
 
393 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  37.73 
 
 
393 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  37.73 
 
 
393 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  37.3 
 
 
403 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  37.73 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  37.47 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  39.58 
 
 
409 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  41.92 
 
 
424 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 
397 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  40.93 
 
 
403 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  37.31 
 
 
395 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 
424 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  39.85 
 
 
406 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  35.4 
 
 
411 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  41.94 
 
 
432 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 
410 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  40.93 
 
 
404 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  43.32 
 
 
403 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  37.83 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  39.55 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  37.53 
 
 
394 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  37.53 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  37.28 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  41.94 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  37.53 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  38.6 
 
 
405 aa  196  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  40.61 
 
 
391 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  37.28 
 
 
394 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  39.19 
 
 
406 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 
397 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 
430 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 
399 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 
445 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  40.6 
 
 
424 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  40.11 
 
 
382 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
428 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 
421 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
430 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 
423 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  36.74 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  32.51 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  39.09 
 
 
401 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  42.77 
 
 
366 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 
415 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  36.6 
 
 
404 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  38.03 
 
 
402 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  28.34 
 
 
368 aa  176  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
413 aa  176  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
398 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
496 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  35.26 
 
 
409 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
437 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
401 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  32.96 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 
411 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  36.13 
 
 
436 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  35.42 
 
 
397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  38.64 
 
 
405 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  32.05 
 
 
421 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  36.08 
 
 
466 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  37.4 
 
 
414 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  35.26 
 
 
444 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  33.88 
 
 
419 aa  155  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  28.97 
 
 
434 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  30.13 
 
 
404 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 
417 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
403 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  31.22 
 
 
402 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  31.23 
 
 
408 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  33.51 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2000  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
394 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>