198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3854 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  60.36 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  54.35 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  54.59 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 411 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 416 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  49.09 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  49.37 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  49.12 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  49.12 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  48.87 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  48.87 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  48.03 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  48.03 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  48.03 
 
 		 393 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  48.03 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  48.03 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  48.03 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  47.91 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  47.77 
 
 		 393 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  47.77 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  44.18 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 413 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 424 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 404 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 404 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  36.18 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  34.4 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  34.22 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  34.69 
 
 		 426 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  34.04 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  33.6 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  35.39 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  36 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  34.45 
 
 		 436 aa  192  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  34.86 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  32.43 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  34.33 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  34.16 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  34.11 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  34.58 
 
 		 424 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  34.49 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  31.95 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  34.86 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  34.58 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 459 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 397 aa  156  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 413 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  32.1 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  30.87 
 
 		 388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  32.08 
 
 		 455 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  31.23 
 
 		 419 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 437 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  33.95 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  32.22 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30.87 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 406 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>