189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01782 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  100 
 
 		 426 aa  811    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  85.96 
 
 		 404 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  85.96 
 
 		 404 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  59.94 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  60.22 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  58.84 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  59.34 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  53.71 
 
 		 409 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  54.41 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  56.99 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  62.91 
 
 		 424 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  61.81 
 
 		 424 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  54.03 
 
 		 407 aa  345  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 402 aa  343  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  53.66 
 
 		 403 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  46.78 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 401 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  48.11 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  48.27 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  48 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  47.97 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  52.14 
 
 		 459 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  44.19 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  47.87 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  36.11 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  38.02 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  41.07 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 424 aa  203  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  38.8 
 
 		 451 aa  203  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 439 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  37.88 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  36.29 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  36.29 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  36.29 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  39.73 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  36.29 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  36.29 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  36.29 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  37.5 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  37.76 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  37.5 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  36.1 
 
 		 398 aa  196  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  36.03 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  36.29 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  37.5 
 
 		 394 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  37.24 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  38.36 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  37.24 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 399 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 397 aa  180  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30.23 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 411 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 496 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  37.16 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 409 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  35.15 
 
 		 399 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 413 aa  159  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  36.75 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  35.28 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2000  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0556  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>