275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0556 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0556  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 403 aa  759    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32460  cyanate permease  43.14 
 
 		 455 aa  275  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 		 410 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2714  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 429 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0867  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.581158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0709  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  31.62 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 404 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 404 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  36.08 
 
 		 426 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 404 aa  156  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 434 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  35.93 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  36.24 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  35.1 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  33.79 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  34.72 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 435 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  34.26 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  33.24 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  33.43 
 
 		 426 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  33.89 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  33.33 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  34.4 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  29.06 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  31.22 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  34.22 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  31.22 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  30.81 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  31.65 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  30.94 
 
 		 394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  31.22 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  27.68 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  35.11 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  28.39 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  28.39 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  28.39 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  28.39 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  28.39 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  28.39 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  28.39 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  28.13 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  33.07 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  33 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 445 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  28.13 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  34.2 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  34.4 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 396 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  23.78 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  32.43 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  31.69 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  27.13 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  33.45 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  25.68 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  25.07 
 
 		 387 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>