200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1076 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  90.46 
 
 		 409 aa  690    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  100 
 
 		 414 aa  797    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  75.6 
 
 		 434 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  74.64 
 
 		 434 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  74.88 
 
 		 426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  73.91 
 
 		 426 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  73.67 
 
 		 426 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  67.47 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  67.47 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  55.67 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  54.42 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  53.05 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  54.97 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  52.49 
 
 		 382 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  51.06 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  52.59 
 
 		 391 aa  326  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  50.48 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  55.18 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  48.54 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 405 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 405 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 		 437 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  40.67 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 444 aa  245  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  39.38 
 
 		 393 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  39.38 
 
 		 393 aa  229  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  39.38 
 
 		 393 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  39.38 
 
 		 393 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  39.38 
 
 		 393 aa  229  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  39.38 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  37.88 
 
 		 403 aa  229  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  39.64 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  40.6 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  39.12 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  40.37 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  42.63 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 424 aa  226  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  39.12 
 
 		 398 aa  226  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  43.1 
 
 		 388 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 413 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 411 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  39.84 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  38.89 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  39.94 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  42.07 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  39.74 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  40.11 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  39.74 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  39.74 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 445 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  39.48 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 416 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 436 aa  209  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  33.42 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 434 aa  196  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2000  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 429 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  32.3 
 
 		 436 aa  172  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 415 aa  172  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  34.91 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 466 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 394 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 439 aa  169  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  31 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>