233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3546 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  768    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  90.46 
 
 		 409 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  96.31 
 
 		 409 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  45.14 
 
 		 408 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  45.86 
 
 		 408 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  45.93 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  44.82 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  45.79 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  44.47 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  46.58 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  44.47 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  45.26 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  45.26 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  45 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  45 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  45.77 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  45.55 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  49.46 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  47.18 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 408 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  42.5 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 401 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  43.73 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  38.38 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  37.86 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  34.87 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  34.39 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  34.39 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  34.39 
 
 		 426 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  33.53 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  34.39 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  38.06 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  38.53 
 
 		 401 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  38.53 
 
 		 394 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  35.88 
 
 		 424 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  38.24 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  38.24 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  32.31 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  35.59 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  32.7 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  32.51 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  32.51 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  38.32 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  32.19 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  33.72 
 
 		 387 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  32.77 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  26.7 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  31.83 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  33.97 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  31.59 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  33.08 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>